Das Museum ist seit 1973 in einem Gebäude aus dem 17. Jh. untergebracht, das als Jesuiten-Schule errichtet worden ist und das später die Handelsschule aufgenommen hat.
Das Museum beherbergt wichtige Funde vor allem aus Gräber, die auf Naxos und auf den benachbarten Inseln Keros, Kouphonissi kai Donoussa gefunden worden sind; die stammen aus der Zeit zwischen dem Neolithikum und der Spätantike (um 5.300 v. – 500 n. Chr.).
Die Sammlung der frühkykladischen Idole zählt nach derjenigen des Athener Nationalmuseums zu den vollstaändigsten. Sie sind in einer großen Vitrine im Untergeschoß zusammen mit anderen Funden dieser Zeit ausgestellt (um 3.200 – 2.300 v. Chr.), darunter Kykladenpfannen und Marmorkratere. Besonders interessant sind ein maskenförmiges Tongefäß, eine Zwillingspyxis aus blaugrauen Marmor mit horizontaler Äderung und ein tiergestaltiges Tongefäß.
Eine große Zahl von Fundstücken stammt aus spätmykenischer (um 1.400 – 1.100 v. Chr.) und geometrischer Zeit (um 900 – 700 v. Chr.).
In den übrigen Sälen des Untergeschosses sind u.a. Tongefäße, Statuetten, Grabstelen und Glasgefäße ausgestellt.
In Saal im Erdgeschoß sieht man vier Kurostorsen, schöne Beispiele der naxischen Plastik archaischer Zeit, eine Palmette von einer Grabstele und eine weibliche Statue aus klassischer Zeit.
Im Vorraum und im Korridor des Erdgeschosses sieht man Grabstellen, Architekturglieder, einen Marmorlöwen und den überlebensgroßen Torso eines römischen Feldherrn mit reliefgeschmücktem Panzer.
Im Hof ist ein Mosaik aus einem römischen Wohnhaus des 3 Jhs. n. Chr. ausgelegt. Im Zentrum ist eine weibliche, auf Meeresungeheuer reitende Gestalt dargestellt, die von Pfauen und Hirschen umgeben ist.
Im selben Gebäude ist das Historische Archiv von Naxos untergebracht.
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Erevnites Edition
GR.OK.F.B.
Naxos, Archäologisches Museum
84300 Chora
